Wenn du die Larven schon rumkriechen siehst, würde ich auch was dagegen machen. Die Mücken selber sind zwar nervig, aber richten eigentlich keinen Schaden an. Die Larven werden, grad für Jungpflanzen, zum Problem. Dagegen kann man zum Beispiel Neudomück nutzen. Sind Bakterien, also was biologisches. Genauso gibt`s Nutznematoden dafür, ebenfalls biologisch. Beides gibt man ins Gießwasser und damit in die Erde.
Wenn du dann noch die Mücken mit Gelbtafeln absammelst, sollte sich das Problem eigentlich lösen.